Objectif

Ce contrat s’inscrit dans le cadre du projet « MAGNOLIA » (MRI imAGe aNalysis Optimization of morphoLogy and hemodynamIcs in the thoracic Aorta) financé par l’Agence Nationale de la Recherche, dont le but global est d’accélérer l’examen d’IRM aortique, en termes à la fois d’acquisition et d’analyse d’images, afin d’améliorer le confort du patient et son diagnostic et d’optimiser le temps du manipulateur et du radiologue. Le but de ce projet est de développer un logiciel permettant la mesure quantitative automatisée des atteintes aortiques à partir d’images IRM 2D ou 3D+t.

Missions

L’ingénieur(e) recruté(e) sur ce projet aura pour missions de :

• Regrouper et si nécessaire traduire, optimiser les logiciels de traitement d’images déjà développés au sein d’iCV historiquement sous Matlab, C/C++ et plus récemment Python, sous une solution unique qui soit conviviale, intuitive et puisse être facilement prise en main, rapide et la plus automatisée possible, libre (préférablement en Python)
• Intégrer les fonctionnalités en cours de développement, notamment les modèles d’apprentissage profond pour automatiser les étapes de segmentation mis au point par les doctorants de l’équipe
• Ajouter les fonctionnalités manquantes, telles que la lecture et l’analyse de nouvelles images ou nouveaux formats IRM récemment disponibles notamment pour la caractérisation tissulaire de la paroi aortique, l’implémentation de critères permettant d’évaluer la qualité des images ou la quantification d’indices plus avancés
• Rédiger la documentation technique et le guide utilisateur
• Interagir et assurer un suivi avec les utilisateurs de l’outil développé, dont les expertises sont complémentaires en IRM, traitement d’images, développement logiciel, intelligence artificielle et expertise clinique, radiologique et cardiovasculaire : chercheurs, radiologues, technicien(ne) recruté(e) sur le projet, doctorants, stagiaires de M2

Ces missions seront menées au LIB à Paris (15 rue de l’Ecole de Médecine) et le budget du projet inclut aussi l’achat de matériel informatique performant et l’équipe dispose de serveurs de calcul et de stockage et des données IRM annotées. Les résultats obtenus seront partagés dans des revues et conférences spécialisées mais aussi auprès du grand public lors de rencontres notamment à la Fête de la Science.

Plus de détails.

Contact

Emilie Bollache (emilie.bollache@inserm.fr), Nadjia Kachenoura (nadjia.kachenoura@inserm.fr )